Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
IFNB1P01574 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms