Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX58O95786 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX58O95786 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX58O95786 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX58O95786 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX58O95786 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms