Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG7O95352 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG7O95352 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG7O95352 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG7O95352 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG7O95352 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG7O95352 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG7O95352 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG7O95352 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG7O95352 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms