Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATG12O94817 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG12O94817 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG12O94817 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG12O94817 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG12O94817 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG12O94817 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG12O94817 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG12O94817 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATG12O94817 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms