Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC45O75419 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC45O75419 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC45O75419 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC45O75419 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC45O75419 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC45O75419 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC45O75419 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDC45O75419 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDC45O75419 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDC45O75419 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC45O75419 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC45O75419 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC45O75419 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC45O75419 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC45O75419 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC45O75419 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC45O75419 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC45O75419 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC45O75419 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC45O75419 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC45O75419 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms