Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYTIPO60759 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms