Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KIAA0556O60303 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms