Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms