Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRGAP3O43295 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms