Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PSMD3O43242 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms