Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CLGNO14967 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLGNO14967 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms