Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UBXN8O00124 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms