Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
J3KRW8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
J3KRW8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
J3KRW8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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