Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
E9PCH4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
E9PCH4 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
E9PCH4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
E9PCH4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E9PCH4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E9PCH4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E9PCH4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E9PCH4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E9PCH4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E9PCH4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E9PCH4 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E9PCH4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E9PCH4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
E9PCH4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
E9PCH4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
E9PCH4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
E9PCH4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E9PCH4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
E9PCH4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
E9PCH4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
E9PCH4 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
E9PCH4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
E9PCH4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E9PCH4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E9PCH4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
E9PCH4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
E9PCH4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms