Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms