Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC69A6NI79 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC69A6NI79 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms