Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NEMP2A6NFY4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms