Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VWA3AA6NCI4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms