Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NUBP2Q9Y5Y2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUBP2Q9Y5Y2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUBP2Q9Y5Y2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms