Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHB2Q9Y5E7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB2Q9Y5E7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PCDHB2Q9Y5E7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB2Q9Y5E7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms