Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4BQ9Y4P1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4BQ9Y4P1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4BQ9Y4P1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATG4BQ9Y4P1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG4BQ9Y4P1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG4BQ9Y4P1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATG4BQ9Y4P1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATG4BQ9Y4P1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4BQ9Y4P1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4BQ9Y4P1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms