Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
USP15Q9Y4E8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP15Q9Y4E8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
USP15Q9Y4E8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms