Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
R3HCC1Q9Y3T6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
R3HCC1Q9Y3T6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
R3HCC1Q9Y3T6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 618.3 ms