Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HDGFL3Q9Y3E1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDGFL3Q9Y3E1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms