Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
ZDHHC9Q9Y397 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ZDHHC9Q9Y397 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZDHHC9Q9Y397 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZDHHC9Q9Y397 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZDHHC9Q9Y397 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms