Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM2AQ9Y2K7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KDM2AQ9Y2K7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM2AQ9Y2K7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM2AQ9Y2K7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM2AQ9Y2K7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KDM2AQ9Y2K7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
KDM2AQ9Y2K7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
KDM2AQ9Y2K7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms