Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SBNO2Q9Y2G9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
SBNO2Q9Y2G9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SBNO2Q9Y2G9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
SBNO2Q9Y2G9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SBNO2Q9Y2G9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SBNO2Q9Y2G9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms