Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAPPC4Q9Y296 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAPPC4Q9Y296 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRAPPC4Q9Y296 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAPPC4Q9Y296 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms