Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y228

TRAF3IP3, TRAF3-interacting JNK-activating modulator, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP3Q9Y228 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRAF3IP3Q9Y228 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAF3IP3Q9Y228 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAF3IP3Q9Y228 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAF3IP3Q9Y228 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms