Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ84

EXO1, Exonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO1Q9UQ84 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXO1Q9UQ84 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EXO1Q9UQ84 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EXO1Q9UQ84 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms