Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SHANK2Q9UPX8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
SHANK2Q9UPX8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
SHANK2Q9UPX8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SHANK2Q9UPX8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SHANK2Q9UPX8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
SHANK2Q9UPX8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SHANK2Q9UPX8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
SHANK2Q9UPX8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
SHANK2Q9UPX8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SHANK2Q9UPX8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
SHANK2Q9UPX8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
SHANK2Q9UPX8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SHANK2Q9UPX8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms