Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC8A2Q9UPR5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC8A2Q9UPR5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC8A2Q9UPR5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC8A2Q9UPR5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms