Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX6Q9UNH7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX6Q9UNH7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX6Q9UNH7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX6Q9UNH7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms