Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
L1RE1Q9UN81 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
L1RE1Q9UN81 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
L1RE1Q9UN81 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
L1RE1Q9UN81 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.1 ms