Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP18Q9UMW8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
USP18Q9UMW8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
USP18Q9UMW8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP18Q9UMW8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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