Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PADI4Q9UM07 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PADI4Q9UM07 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PADI4Q9UM07 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PADI4Q9UM07 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms