Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MBD1Q9UIS9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD1Q9UIS9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MBD1Q9UIS9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms