Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUFIP1Q9UHK0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NUFIP1Q9UHK0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NUFIP1Q9UHK0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NUFIP1Q9UHK0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms