Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNN3Q9UGI6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNN3Q9UGI6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms