Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM10Q9UDY6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM10Q9UDY6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM10Q9UDY6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM10Q9UDY6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM10Q9UDY6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM10Q9UDY6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRIM10Q9UDY6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms