Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NKX1-2Q9UD57 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-2Q9UD57 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NKX1-2Q9UD57 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX1-2Q9UD57 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms