Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM8A1Q9UBU6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM8A1Q9UBU6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM8A1Q9UBU6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM8A1Q9UBU6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM8A1Q9UBU6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM8A1Q9UBU6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM8A1Q9UBU6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM8A1Q9UBU6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM8A1Q9UBU6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM8A1Q9UBU6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM8A1Q9UBU6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM8A1Q9UBU6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM8A1Q9UBU6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM8A1Q9UBU6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM8A1Q9UBU6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms