Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NLKQ9UBE8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLKQ9UBE8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NLKQ9UBE8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms