Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC5

MYO1A, Unconventional myosin-Ia, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1AQ9UBC5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MYO1AQ9UBC5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MYO1AQ9UBC5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MYO1AQ9UBC5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
MYO1AQ9UBC5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MYO1AQ9UBC5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms