Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTGFRNQ9P2B2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGFRNQ9P2B2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTGFRNQ9P2B2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTGFRNQ9P2B2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms