Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC52.09■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC52.09■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.08■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.08■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.08■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.08■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.07■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC52.07■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.07■■■■■ 5.93
CCDC180Q9P1Z9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC52.06■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC52.06■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC52.05■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC52.04■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC52.04■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC52.04■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC52.04■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC52.04■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.04■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC52.04■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.03■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.03■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC52.02■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC52.02■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC52.02■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.02■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC52.01■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC52.01■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.01■■■■■ 5.92
CCDC180Q9P1Z9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5.91
CCDC180Q9P1Z9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52■■■■■ 5.91
CCDC180Q9P1Z9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC51.99■■■■■ 5.91
CCDC180Q9P1Z9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC51.99■■■■■ 5.91
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.98■■■■■ 5.91
CCDC180Q9P1Z9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.97■■■■■ 5.91
CCDC180Q9P1Z9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC51.97■■■■■ 5.91
CCDC180Q9P1Z9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.97■■■■■ 5.91
CCDC180Q9P1Z9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC51.95■■■■■ 5.91
CCDC180Q9P1Z9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC51.94■■■■■ 5.91
CCDC180Q9P1Z9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC51.93■■■■■ 5.9
CCDC180Q9P1Z9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.93■■■■■ 5.9
CCDC180Q9P1Z9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.93■■■■■ 5.9
CCDC180Q9P1Z9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC51.92■■■■■ 5.9
CCDC180Q9P1Z9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC51.92■■■■■ 5.9
CCDC180Q9P1Z9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC51.92■■■■■ 5.9
CCDC180Q9P1Z9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.91■■■■■ 5.9
CCDC180Q9P1Z9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC51.9■■■■■ 5.9
CCDC180Q9P1Z9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
CCDC180Q9P1Z9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.89■■■■■ 5.9
CCDC180Q9P1Z9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.88■■■■■ 5.9
CCDC180Q9P1Z9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC51.87■■■■■ 5.89
CCDC180Q9P1Z9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC51.86■■■■■ 5.89
CCDC180Q9P1Z9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC51.86■■■■■ 5.89
CCDC180Q9P1Z9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC51.86■■■■■ 5.89
CCDC180Q9P1Z9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC51.86■■■■■ 5.89
CCDC180Q9P1Z9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC51.86■■■■■ 5.89
CCDC180Q9P1Z9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.86■■■■■ 5.89
CCDC180Q9P1Z9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC51.83■■■■■ 5.89
CCDC180Q9P1Z9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC51.83■■■■■ 5.89
CCDC180Q9P1Z9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC51.81■■■■■ 5.88
CCDC180Q9P1Z9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.81■■■■■ 5.88
CCDC180Q9P1Z9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.8■■■■■ 5.88
CCDC180Q9P1Z9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.8■■■■■ 5.88
CCDC180Q9P1Z9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.79■■■■■ 5.88
CCDC180Q9P1Z9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.76■■■■■ 5.88
CCDC180Q9P1Z9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC51.76■■■■■ 5.88
CCDC180Q9P1Z9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC51.76■■■■■ 5.88
CCDC180Q9P1Z9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.76■■■■■ 5.88
CCDC180Q9P1Z9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.76■■■■■ 5.88
CCDC180Q9P1Z9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.75■■■■■ 5.88
CCDC180Q9P1Z9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.75■■■■■ 5.87
CCDC180Q9P1Z9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
CCDC180Q9P1Z9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC51.74■■■■■ 5.87
CCDC180Q9P1Z9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
CCDC180Q9P1Z9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC51.74■■■■■ 5.87
CCDC180Q9P1Z9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.74■■■■■ 5.87
CCDC180Q9P1Z9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC51.73■■■■■ 5.87
CCDC180Q9P1Z9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
CCDC180Q9P1Z9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC51.71■■■■■ 5.87
CCDC180Q9P1Z9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.71■■■■■ 5.87
CCDC180Q9P1Z9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
CCDC180Q9P1Z9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.7■■■■■ 5.87
CCDC180Q9P1Z9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC51.69■■■■■ 5.87
CCDC180Q9P1Z9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC51.69■■■■■ 5.87
CCDC180Q9P1Z9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC51.68■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC51.68■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC51.67■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC51.67■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.67■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.66■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC51.65■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC51.65■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.65■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC51.65■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC51.64■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC51.63■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.63■■■■■ 5.86
CCDC180Q9P1Z9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC51.62■■■■■ 5.85
CCDC180Q9P1Z9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC51.62■■■■■ 5.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms