Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHMP5Q9NZZ3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHMP5Q9NZZ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CHMP5Q9NZZ3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHMP5Q9NZZ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms