Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NCKIPSDQ9NZQ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKIPSDQ9NZQ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKIPSDQ9NZQ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCKIPSDQ9NZQ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms