Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI8

IGF2BP1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGF2BP1Q9NZI8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.719e-8■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 TOP2A-205ENST00000581055 579 ntTSL 418.03■□□□□ 0.484e-10■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 BIRC2-207ENST00000531259 572 ntTSL 515.78■□□□□ 0.129e-8■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -09e-8■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.159e-8■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 BIRC2-213ENST00000613397 4066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.419e-8■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.481e-9■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 BIRC2-204ENST00000527910 4073 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.589e-8■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 BIRC2-201ENST00000227758 3743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.639e-8■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 NET1-205ENST00000484741 757 ntTSL 28.22□□□□□ -1.094e-10■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 BIRC2-205ENST00000528344 866 ntTSL 57.97□□□□□ -1.139e-8■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.344e-10■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 ZMYM6-209ENST00000493328 6241 ntTSL 1 (best)6.47□□□□□ -1.374e-10■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.444e-10■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM38B-204ENST00000435034 721 ntTSL 35.81□□□□□ -1.481e-9■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 ZMYM6-208ENST00000472971 632 ntTSL 34.75□□□□□ -1.654e-10■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.741e-9■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.387e-7■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.147e-7■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 PROSER1-205ENST00000484434 2150 ntTSL 29.16□□□□□ -0.947e-7■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 CCNG1-213ENST00000514367 573 ntTSL 26.97□□□□□ -1.293e-9■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.171e-8■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 POC1B-212ENST00000549591 5840 ntTSL 1 (best)10.16□□□□□ -0.781e-8■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 POC1B-204ENST00000546740 911 ntTSL 26.87□□□□□ -1.311e-8■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.321e-8■■■■■ 31.7
IGF2BP1Q9NZI8 SREBF1-206ENST00000423161 1058 ntTSL 318.15■□□□□ 0.51e-8■■■■■ 31.6
IGF2BP1Q9NZI8 SREBF1-211ENST00000476994 591 ntTSL 217.61■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 31.6
IGF2BP1Q9NZI8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 31.6
IGF2BP1Q9NZI8 SREBF1-222ENST00000583732 580 ntTSL 414.78□□□□□ -0.041e-8■■■■■ 31.6
IGF2BP1Q9NZI8 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 31.6
IGF2BP1Q9NZI8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.132e-9■■■■■ 31.6
IGF2BP1Q9NZI8 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.082e-9■■■■■ 31.6
IGF2BP1Q9NZI8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.022e-9■■■■■ 31.6
IGF2BP1Q9NZI8 FOXRED2-202ENST00000366463 2489 ntTSL 212.62□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 31.6
IGF2BP1Q9NZI8 CTSB-227ENST00000533110 399 ntTSL 58.84□□□□□ -0.993e-10■■■■■ 31.6
IGF2BP1Q9NZI8 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.573e-8■■■■■ 31.5
IGF2BP1Q9NZI8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.938e-10■■■■■ 31.5
IGF2BP1Q9NZI8 SF3A1-202ENST00000411423 548 ntTSL 418.76■□□□□ 0.598e-10■■■■■ 31.5
IGF2BP1Q9NZI8 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.218e-10■■■■■ 31.5
IGF2BP1Q9NZI8 SF3A1-203ENST00000444440 777 ntTSL 510.67□□□□□ -0.78e-10■■■■■ 31.5
IGF2BP1Q9NZI8 NCKAP1-202ENST00000361354 20347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.078e-10■■■■■ 31.5
IGF2BP1Q9NZI8 SLC25A37-210ENST00000522164 571 ntTSL 217.4■□□□□ 0.382e-19■■■■■ 31.4
IGF2BP1Q9NZI8 PDIA3-202ENST00000434494 2107 ntTSL 214.64□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 31.4
IGF2BP1Q9NZI8 PDIA3-201ENST00000300289 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 31.4
IGF2BP1Q9NZI8 SLC25A37-211ENST00000523883 3651 ntTSL 210.04□□□□□ -0.82e-19■■■■■ 31.4
IGF2BP1Q9NZI8 PDIA3-204ENST00000455250 725 ntTSL 58.18□□□□□ -1.15e-6■■■■■ 31.4
IGF2BP1Q9NZI8 PABPC1-213ENST00000519848 676 ntTSL 28.4□□□□□ -1.062e-23■■■■■ 31.4
IGF2BP1Q9NZI8 A2M-210ENST00000542567 563 ntTSL 46.9□□□□□ -1.38e-38■■■■■ 31.4
IGF2BP1Q9NZI8 TMEM123-207ENST00000531103 568 ntTSL 46.64□□□□□ -1.352e-20■■■■■ 31.4
IGF2BP1Q9NZI8 TCF12-220ENST00000560887 540 ntTSL 46.67□□□□□ -1.344e-7■■■■■ 31.3
IGF2BP1Q9NZI8 GATAD1-203ENST00000493878 2017 ntTSL 1 (best)11.76□□□□□ -0.532e-11■■■■■ 31.3
IGF2BP1Q9NZI8 GATAD1-202ENST00000465247 797 ntTSL 29.89□□□□□ -0.832e-11■■■■■ 31.3
IGF2BP1Q9NZI8 DCP2-207ENST00000513585 1572 ntTSL 216.66■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 31.3
IGF2BP1Q9NZI8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 SEC31A-227ENST00000508502 3801 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.283e-7■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.963e-7■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.133e-7■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 NAA25-208ENST00000552527 5815 ntTSL 24.28□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 RNF168-202ENST00000437070 2202 ntTSL 217.54■□□□□ 0.43e-8■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.127e-10■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 NUP98-206ENST00000397013 939 ntTSL 57.69□□□□□ -1.187e-10■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 KMT2E-205ENST00000473063 375 ntTSL 1 (best)5.27□□□□□ -1.573e-8■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 SYPL1-203ENST00000460770 545 ntTSL 1 (best)4.55□□□□□ -1.683e-19■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 EIF2AK1-209ENST00000490523 905 ntTSL 28.73□□□□□ -1.017e-14■■■■■ 31.2
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.369e-7■■■■■ 31.1
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.399e-7■■■■■ 31.1
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.449e-7■■■■■ 31.1
IGF2BP1Q9NZI8 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.489e-7■■■■■ 31.1
IGF2BP1Q9NZI8 NACA-218ENST00000551775 449 ntTSL 57.84□□□□□ -1.152e-17■■■■■ 31.1
IGF2BP1Q9NZI8 NACA-206ENST00000546862 492 ntTSL 34.51□□□□□ -1.692e-17■■■■■ 31.1
IGF2BP1Q9NZI8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.016e-7■■■■■ 31.1
IGF2BP1Q9NZI8 TRAPPC8-207ENST00000580104 5014 ntTSL 213.68□□□□□ -0.226e-7■■■■■ 31.1
IGF2BP1Q9NZI8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.945e-9■■■■■ 31.1
IGF2BP1Q9NZI8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.425e-9■■■■■ 31.1
IGF2BP1Q9NZI8 SCAMP4-204ENST00000414057 1477 ntTSL 1 (best)16.7■□□□□ 0.265e-9■■■■■ 31.1
IGF2BP1Q9NZI8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.235e-9■■■■■ 31.1
IGF2BP1Q9NZI8 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 515.8■□□□□ 0.125e-9■■■■■ 31.1
IGF2BP1Q9NZI8 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC5.06□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 31.1
IGF2BP1Q9NZI8 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.061e-7■■■■■ 31
IGF2BP1Q9NZI8 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 31
IGF2BP1Q9NZI8 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.51e-7■■■■■ 31
IGF2BP1Q9NZI8 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.12e-8■■■■■ 31
IGF2BP1Q9NZI8 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.362e-8■■■■■ 31
IGF2BP1Q9NZI8 SMAD2-205ENST00000586040 1971 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.882e-8■■■■■ 31
IGF2BP1Q9NZI8 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-11■■■■■ 31
IGF2BP1Q9NZI8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.37e-9■■■■■ 31
IGF2BP1Q9NZI8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.812e-9■■■■■ 31
IGF2BP1Q9NZI8 BLOC1S6-201ENST00000220531 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.842e-9■■■■■ 31
IGF2BP1Q9NZI8 BLOC1S6-218ENST00000568816 4013 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.882e-9■■■■■ 31
IGF2BP1Q9NZI8 BLOC1S6-205ENST00000564310 636 ntTSL 37.19□□□□□ -1.262e-9■■■■■ 31
IGF2BP1Q9NZI8 BCAT1-208ENST00000544418 2320 ntTSL 1 (best)14.78□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 31
IGF2BP1Q9NZI8 MED15-226ENST00000478831 707 ntTSL 411.33□□□□□ -0.63e-10■■■■■ 30.9
IGF2BP1Q9NZI8 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 30.9
IGF2BP1Q9NZI8 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.224e-8■■■■■ 30.9
Retrieved 100 of 17,531 protein–RNA pairs in 296.4 ms