Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RRN3Q9NYV6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RRN3Q9NYV6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RRN3Q9NYV6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRN3Q9NYV6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
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